东华三院辖下位于荷李活道的文武庙及山东街的水月宫均安装由香港生产力促进局设计的清烟环保炉。由于庙宇香火鼎盛且位处市区，安装清烟环保炉可减低焚烧元宝的烟雾对空气的影响。现时使用的清烟环保炉经多项环保测试，证实在减低烟雾方面的效果良好及符合环保要求。

本院正积极争取于辖下其它庙宇，包括太平山街广福祠、油麻地天后庙群、湾仔洪圣庙及大角咀洪圣庙增加清烟环保炉。另将把环保香推广至本院承办庙宇，包括山东街水月宫、油麻地天后庙群、湾仔洪圣庙及大角咀洪圣庙，供参拜善信选购。